"Но вполне очевидно, что мы не можем оплачивать работы, которые были выполнены с нарушениями. В данном случае это нарушения по срокам. Соответственно, на данный момент позиция администрации такова: мы не собираемся оплачивать то, что подрядчиками не было сделано вовремя. В остальном разберется суд."
В администрации работают и_д_и_о_т_ы? Что значит: не оплатим то, что было сделано не вовремя? Оплатить обязаны, а если есть претензии к подрядчику по срокам - то взыскивать неустойку. Не оплатить можно некачественные или недоделанные работы.